Esta é uma dúvida recorrente, sempre que apresento o recurso de Code Analysis para um cliente:

“Com essa enorme quantidade de regras, quais eu realmente devo ligar?”

Ainda que não haja uma resposta precisa a essa pergunta – é sempre necessário analisar o cenário do cliente para entender quais regras fazem sentido – um bom ponto de partida é o post do time do FxCop (no qual o Code Analysis do Team System é baseado):

What rules do Microsoft have turned on internally?

Se você usa o recurso de testes Web (“Web Tests”) do Team System Test Edition, certamente vai querer ler as dicas de resolução de problemas que o Sean Lumlev postou no seu blog. Confira o post How to debug a Web Test.